В начале войны был призван в ряды Красной Армии и направлен на Краснознаменный Балтийский флот в качестве научно-технического консультанта. За выполнение ряда спецзаданий по улучшению боеспособности кораблей майор-инженер Н. Болдырев был награжден орденами Красной Звезды, Трудового Красного Знамени и рядом медалей. После Победы работал заведующим кафедрой высшей математики ЛЭТИ, последние 15 лет жизни работал профессором кафедры вычислительной техники ЛЭТИ.